記者從西交利物浦大學(xué)獲悉,由該校生物科學(xué)系孟佳博士帶領(lǐng)的科研團(tuán)隊,近期實現(xiàn)了對全轉(zhuǎn)錄組RNA分子m6A修飾的最精準(zhǔn)預(yù)測,相當(dāng)于繪制了人類迄今為止最精準(zhǔn)的m6A表觀轉(zhuǎn)錄修飾地圖。進(jìn)一步研究或?qū)⒔沂净蛐誀钆c人類某些重大疾病的關(guān)聯(lián)作用。相關(guān)研究成果已于近日發(fā)表在生物信息領(lǐng)域知名期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上。
據(jù)介紹,“RNA修飾”指的是發(fā)生在RNA分子上的生物化學(xué)修飾,可以在不改變RNA分子序列信息的情況下改變其特性,并調(diào)控基因信息的表達(dá)。“目前已知的RNA修飾有100多種,其中m6A修飾是含量最高的一種。”孟佳解釋道。
“最近,已有研究表明m6ARNA甲基化修飾的酶在白血病、膠質(zhì)母細(xì)胞瘤、非小細(xì)胞肺癌、乳腺癌等疾病中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。”孟佳介紹道。
孟佳指出,在RNA修飾領(lǐng)域,西交利物浦大學(xué)團(tuán)隊是第一個應(yīng)用35種組學(xué)信息進(jìn)行預(yù)測的科研團(tuán)隊。“過去的研究只考慮序列信息,預(yù)測的準(zhǔn)確率是80%,在此基礎(chǔ)上我們加入了35種其他組學(xué)信息,使準(zhǔn)確性提升到90%,這是一個比較大的突破。”孟佳補充道。
據(jù)研究團(tuán)隊成員,西浦生物科學(xué)系博士生陳鯤淇介紹,在繪制m6A表觀轉(zhuǎn)錄組地圖的過程中,該團(tuán)隊運用機(jī)器學(xué)習(xí)的技術(shù),通過已有的特征,訓(xùn)練出預(yù)測模型,該工作為未來人類RNA修飾領(lǐng)域的研究工作提供了更為可靠的參考信息。
據(jù)介紹,“RNA修飾”指的是發(fā)生在RNA分子上的生物化學(xué)修飾,可以在不改變RNA分子序列信息的情況下改變其特性,并調(diào)控基因信息的表達(dá)。“目前已知的RNA修飾有100多種,其中m6A修飾是含量最高的一種。”孟佳解釋道。
“最近,已有研究表明m6ARNA甲基化修飾的酶在白血病、膠質(zhì)母細(xì)胞瘤、非小細(xì)胞肺癌、乳腺癌等疾病中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。”孟佳介紹道。
孟佳指出,在RNA修飾領(lǐng)域,西交利物浦大學(xué)團(tuán)隊是第一個應(yīng)用35種組學(xué)信息進(jìn)行預(yù)測的科研團(tuán)隊。“過去的研究只考慮序列信息,預(yù)測的準(zhǔn)確率是80%,在此基礎(chǔ)上我們加入了35種其他組學(xué)信息,使準(zhǔn)確性提升到90%,這是一個比較大的突破。”孟佳補充道。
據(jù)研究團(tuán)隊成員,西浦生物科學(xué)系博士生陳鯤淇介紹,在繪制m6A表觀轉(zhuǎn)錄組地圖的過程中,該團(tuán)隊運用機(jī)器學(xué)習(xí)的技術(shù),通過已有的特征,訓(xùn)練出預(yù)測模型,該工作為未來人類RNA修飾領(lǐng)域的研究工作提供了更為可靠的參考信息。